ডাঃ মোঃ শফিউল্লাহ প্রধান ১৯৭৮ সালের ১ ডিসেম্বর চাঁদপুর জেলার হাজীগঞ্জ উপজেলার মেনাপুর গ্রামের এক সম্ভ্রান্ত মুসলিম পরিবারে জন্মগ্রহণ করেন। তাঁর পিতা মোঃ বশির উল্লাহ ছিলেন একজন নিবেদিতপ্রাণ শিক্ষক এবং মাতা জাহানারা বেগম একজন গৃহিণী। তাঁর দাদা ওয়াজির আলী প্রধান ছিলেন একজন প্রখ্যাত শিক্ষক ও পণ্ডিত, যা তাঁর শিক্ষাজীবনের বিকাশে ব্যাপক প্রভাব ফেলেছিল। ডাঃ প্রধান শৈশব থেকেই অত্যন্ত মেধাবী ছিলেন এবং পঞ্চম ও অষ্টম শ্রেণিতে জেলা পর্যায়ে ট্যালেন্টপুল বৃত্তি লাভ করেন। তিনি ১৯৯৪ সালে চাঁদপুরের বিএম হাই স্কুল থেকে প্রথম বিভাগ ও স্টার মার্কসসহ মাধ্যমিক স্কুল সার্টিফিকেট (এসএসসি) পরীক্ষায় উত্তীর্ণ হন। পরবর্তীতে তিনি ১৯৯৬ সালে ঢাকার কুর্মিটোলার বিএএফ শাহীন কলেজ থেকে প্রথম বিভাগে উচ্চ মাধ্যমিক সার্টিফিকেট (এইচএসসি) সম্পন্ন করেন। ২০০০ সালে তিনি ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের চিকিৎসা অনুষদভুক্ত ন্যাশনাল ইনস্টিটিউট অব ট্রমাটোলজি অ্যান্ড অর্থোপেডিক রিহ্যাবিলিটেশন (নিটোর) থেকে ফিজিওথেরাপি বিষয়ে স্নাতক ডিগ্রি অর্জন করেন। তিনি শিক্ষকতা দিয়ে তাঁর পেশাগত জীবন শুরু করেন এবং ২০০৪ সালে বাংলাদেশ মেডিকেল কলেজে প্রভাষক হিসেবে যোগদান করেন। চিকিৎসা বিজ্ঞান পড়ানোর পাশাপাশি তিনি ঢাকা মেট্রোপলিটন মেডিকেল সেন্টারে কনসালট্যান্ট হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন।